Magyarország először 2005-ben jelezte hivatalosan az Európai Bizottságnak, hogy helyszínt kíván adni az EIT irányító testületének. A 2008. február 25-i Versenyképességi Tanács ülésén hazánk újból megerősítette elkötelezettségét. A magyar pályázatot 2008. május 29-én ismertette Brüsszelben Bajnai Gordon nemzeti fejlesztési és gazdasági miniszter, amely alapján a magyar kandidálás szakmai előkészítettségét és megalapozottságát a tagállamok egyértelműen a legjobbnak tartották. A magyar pályázat mellett szólt a magyar szürkeállomány tudományos teljesítményének elismerése, a főváros kiterjedt, széles campus hálózata, a centrális geo-politikai elhelyezkedése és könnyű megközelíthetősége is.

Az Európai Innovációs és Technológiai Intézet lesz a jövő közös Európájának szellemi innovációs központja. Itt fogják megtervezni az európai kutatásfejlesztést, innen fogják finanszírozni, és innen fogják kiválasztani, hogy Európában hol legyenek azok a központok, ahol a konkrét kutatásokat végzik.

A működését várhatóan 2009-ben megkezdő intézet az Infopark egyik új épületében kap helyet. A Magyar Kormány ígéretet tett arra, hogy a központnak otthont adó épület bérleti díját húsz éven keresztül, az intézményben dolgozók közül húsz munkatársnak a bérét pedig öt éven keresztül átvállalja.

Az EIT működésének finanszírozását a közösségi költségvetés 2013-ig 308,7 millió euróval és magánforrások bevonásával biztosítja. Bár a székhely viszonylag kisméretű uniós intézmény lesz, az ún. tudás- és innovációs társulások (KIC-ek) munkáján keresztül átfogja a teljes európai innovációs tevékenységet.  A szakmai munkát végző KIC-ekből 2013-ig valószínűleg három működik majd: a klímaváltozás, az energia és várhatóan az infokommunikáció területén.